عدم تحمل لاکتوز یک مشکل گوارشی بسیار شایع است. در واقع، حدود 75 درصد از جمعیت جهان به این مشکل دچارند.این نوع پنیر برای افرادی که این مشکل را دارا هستند مناسب است و هضم آن اسان تر است پنیر از طریق اضافه کردن باکتریها یا اسید به شیر تهیه میشود و سپس سرشیر که از آب پنیر ساخته میشود از پنیر جدا میگردد.از آنجایی که لاکتوز موجود در شیر در آب پنیر وجود دارد، فرآیند تهیۀ پنیر باعث میشود تا محتوای زیادی از لاکتوز از بین برود.با این حال، مقدار لاکتوز موجود در پنیر میتواند متفاوت باشد و پنیرهایی که کمترین لاکتوز را دارند، محصولاتی هستند که از زمان تولید آنها مدت زیادی گذشته باشد.علت این موضوع این است که باکتریهای موجود در پنیر میتوانند مقداری از لاکتوز باقیمانده در پنیر را تجزیه کنند و مقدار آن را کاهش دهند. هرچه پنیر قدیمیتر باشد، مقدار بیشتری از لاکتوز آن توسط باکتریها تجزیه میشوند.